稱為溶酶體的細胞器分解細胞內的物質。有兩種細胞內消化。異食消化包括分解細胞外的物體,而自噬性細胞內消化涉及到消耗細胞內的成分。這可能發生在細胞饑餓時,如果細胞在尋求能量發揮作用的同時消化了過多的自身物質,則可能導致細胞溶解,也稱為細胞死亡。細胞也可以被編程或觸發,在它們活得更長時開始自我消化它們的作用,或者當它們被病原體感染時。在異食消化中,一旦細胞吞噬了一個目標,細胞內稱為溶酶體的結構就會釋放酶來分解目標。這些酶像剪刀一樣,切斷細胞吞噬的物體的關鍵蛋白質取決于它是什么,它可能被分解成細胞可以回收利用的有用成分,也可以被切割成廢物進行清除,通常一路上會產生一些廢物,它們可以通過細胞壁傳回細胞壁被清除。細胞內消化發生在食物鏈的各個層面,從藍鯨分解細菌的細胞到土壤中的單細胞有機體,將食物來源分解成有用的組分動物也有一個消化道,用于細胞外消化,在消化液的作用下,食物在細胞壁外被分解成有用的成分,這些成分可以進入血液,分布在全身,它們將穿過單個細胞的細胞壁為它們提供能量他們生存所需的其他物資。
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