細胞色素存在于線粒體壁內。有幾種不同類型的細胞色素,它們以多種方式加以區分,包括光譜和對抑制劑的敏感性。它們是細胞色素a、b,c-和c-各有亞型。它們在蛋白質提供血紅素基的環境中變化,這影響細胞色素傳遞電子的能力。電子轉移是呼吸循環的一部分。呼吸作用發生在身體的所有細胞中,它以三磷酸腺苷(ATP)的形式提供能量。這種化合物是細胞能量的普遍來源。富含能量的葡萄糖在線粒體中分解,線粒體是細胞的熔爐。參與呼吸鏈的酶位于線粒體壁上。降解產生的電子葡萄糖一步一步地轉移到主要由細胞色素組成的酶的梯度上。每一步都釋放能量。這有時被稱為細胞色素系統。細胞色素活性部位的鐵以還原或氧化的形式變化。電子流動發生在從還原劑轉變為氧化劑。最后一步是將兩個電子從細胞色素c氧化酶轉移到氧氣中,形成水。這一步與ATP形成耦合,稱為氧化磷酸化含有血紅素基團的蛋白質稱為血紅素,某些細胞色素的血紅素不同,加上蛋白質結構的差異,使細胞色素具有不同的還原電位,因此它們位于呼吸鏈的不同點上,這些酶也存在于線粒體膜、內質網和植物葉綠體中。細胞色素P450是一組完全不同的酶。它們不氧化底物,而是含有一個分子原子。因此,它們是單氧合酶,不像其他細胞色素那樣是氧化酶,它們的活性部位也有一個血紅素基團。P450是一個非常多樣化的酶組。肝臟中有許多不同類型的酶,它們在肝臟中解毒,例如藥物。這些還可以解毒,在人們吃的植物中發現的許多化合物。據認為,這些P450中的許多進化為人類抵御植物中發現的有毒化合物。其他類型的這些酶參與類固醇和激素的生物合成。
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