抗真菌藥物與引起酵母菌感染的真菌作斗爭，有助于緩解癥狀，徹底清除感染。這些藥物有口服藥片和外用藥物，直接用于陰道治療陰道感染。為酵母菌感染選擇最佳的抗真菌藥物包括哪種藥物或藥物組合能最快、最有效地緩解和治愈感染癥狀。
一些抗真菌藥膏可用于生殖器部位以殺死真菌例如念珠菌。
有些人喜歡口服抗真菌藥物治療酵母菌感染。口服藥物通常比局部制劑更有效，因此通常是嚴重感染的更好選擇。然而，口服抗真菌藥物不能立即緩解癥狀，雖然許多口服抗真菌藥物只需要一次劑量的藥物。在許多國家，治療酵母菌感染的口服抗真菌藥物必須由醫生給予或處方。
口服藥物通常是治療嚴重疾病的好選擇酵母菌感染。
外用抗真菌藥物通常用于陰道酵母菌感染，在許多國家都是非處方藥。治療酵母菌感染的霜狀抗真菌藥通常在陰道周圍和陰道內使用，可以幫助暫時緩解灼熱和瘙癢，因為它能對抗感染。抗真菌陰道栓劑也可用，通常是一次性使用的。一個局部抗真菌的酵母感染通常使用幾天，雖然單劑量陰道栓劑可用
酵母感染可通過非處方藥物以陰道栓的形式服用。
由于口服抗真菌藥物通常是單劑量服用的，它們的破壞性較小，而且不容易健忘。酵母感染的局部抗真菌藥物通常需要在三到七天內多次使用，并且在完全按照指示進行治療時最有效。有些人發現局部應用很混亂，很難使用，讓他們成為一個不那么理想的選擇，但在許多情況下，它們確實能立即緩解癥狀。睡前使用外用藥物或栓劑可以幫助患者記住每天使用藥物，并將躺下后的混亂情況降至最低。
感染性病由于不安全的性行為，可能會導致女性陰道真菌感染。
一些酵母感染患者需要聯合治療。外用抗真菌藥物通常是治療感染的首選，但口服和外用藥物可用于特別嚴重的感染。在某些地區，更強的外用藥物只能通過醫生獲得，盡管法規各不相同。大多數酵母感染通過聯合治療和進一步治療通常是不必要的，除非感染經常復發。
必須口服抗真菌藥在大多數國家由醫生開具處方。
在嘗試使用抗真菌藥物治療之前，讓醫生診斷出酵母感染是很重要的雖然通常不需要處方強度的抗真菌藥物來治療酵母感染，但酵母感染的癥狀實際上可能是不同類型感染的癥狀。這些感染通常并不嚴重，但它們可能需要不同類型的藥物或治療方法。
糖尿病女性易患酵母感染。