咪康唑洗發水用于治療真菌感染。雖然咪康唑被批準用于人和動物，但它在動物身上的給藥通常是通過洗發水，而在人身上通常是以軟膏或乳膏的形式給藥。如果使用得當，這種藥物洗發水能有效治療毛癬菌屬真菌引起的皮膚感染，常用于狗和貓。
咪康唑洗發水獲準使用對人類。
許多類型的哺乳動物都會感染由毛癬菌引起的皮膚感染。在動物中，這種感染最常見的類型是癬，而在人類中，腳癬和腳癬更常見。人類通常可以在患處使用含有咪康唑的軟膏，但在動物身上，可能更難分辨出哪些部位受到影響。因此，用咪康唑洗發水進行治療，這種洗發水可以遍布全身，是理想的。
可能使用咪康唑洗發水治療的運動瘙癢患者應避免性行為。
當用咪康唑洗發水治療動物時，必須遵循所有的指導原則。真菌感染很難徹底根除，過早停止治療會導致感染的復發。開處方的獸醫會給出具體的指導，說明多久給動物洗澡，盡管通常一周做兩次，直到癥狀消失，之后一段時間內每周一次咪康唑洗發水用于治療的皮膚感染很容易轉移到皮膚的新區域、其他動物或人類身上，因此，給有皮膚感染的動物洗頭時，采取適當的預防措施是很重要的。
獸醫可以開咪康唑洗發水治療動物真菌感染。
美康唑在洗發水中的通常濃度為2%，這被認為是安全的，適用于6周大的動物。洗發水不會傷害給動物洗澡的人。它不允許在獸醫以外的地方使用，然而，
貓和狗經常用咪康唑洗發水治療。
咪康唑洗發水如果進入粘液膜或進入粘液膜，會對動物造成傷害吞食。洗發水在動物身上時需要有人看管，以免它們舔掉。同樣重要的一點是不要讓動物的眼睛和鼻子接觸，因為它會刺激這些細胞膜。很少情況下，咪康唑洗發水可能會引起腫脹、發紅等不良反應，或者皮疹。這些癥狀應該報告給獸醫。
咪康唑可以是乳膏或軟膏。