硫酸阿托品是第二代謝物阿托品在醫學上最常用的形式，它來自于茄科植物中致命的茄科植物和其他有毒植物。如果使用得當，這種生物堿在人類和獸醫中有著廣泛的用途。它是一種抗膽堿能藥物，因此可以干燥支氣管分泌物，減少出汗，可作為某些中毒的解毒劑。這種配方也可用于眼科，以擴大瞳孔和治療各種眼病。這種藥物的另一個用途是刺激心率極低的人的心跳。
休閑使用阿托品的人不應吃茄子、西紅柿，許多植物次生代謝物在高劑量下是致命的毒物，在低劑量下是有用的化合物。阿托品就是這樣一種化合物。在醫學上，它最常用作硫酸阿托品，通常被稱為山莨菪堿。這種化合物有兩種形式的混合物，d-山莨菪堿和l-山莨菪堿。只有l-山莨菪堿構型的形式被稱為立體異構體，對哺乳動物生理有影響。
硫酸阿托品可以注射給藥。
這種藥物是抗膽堿能藥物的典型例子。此類化合物通過抑制乙酰膽堿來阻斷某些類型神經細胞之間的化學信號傳導作用，這種作用是可逆的。
硫酸阿托品可用于治療特定類型的青光眼。
神經功能需要乙酰膽堿活性抑制其活性的化合物，如有機磷殺蟲劑和神經毒氣，可能是致命的毒物。這種藥物被用作此類中毒的解毒劑，并由部隊進入可能接觸沙林等神經毒氣的地區，以注射的形式攜帶。
抗膽堿能作用可以幫助干燥支氣管分泌物。硫酸阿托品有時是止咳糖漿的成分之一還可抑制出汗，并用于治療患者出汗過多的臨床癥狀。
眼科醫生有時使用含有硫酸阿托品的眼藥水來擴張患者的眼睛，擴大瞳孔。因此，醫生可以更好地觀察眼睛內部，以便進行更徹底的檢查。這種藥物還可以用于治療某些眼部疾病，例如一種特定形式的青光眼。
對于心率過低的危重病例，硫酸阿托品可用于提高發病率。矛盾的是，極低的劑量可能會產生相反的效果。這樣做治療時，該藥物以注射形式施用。
硫酸阿托品與許多其他化合物相互作用，應確保向處方醫生提供所服用的所有處方藥和補充劑的清單。通過服用抗抑郁藥、抗組胺藥、苯二氮卓類藥物，這種藥物的效果會增強，抗精神病藥和其他一些藥物。因此，服用精神病藥物的患者在服用阿托品時可能需要特別小心。這種藥物的解毒劑是天然產物匹羅卡品或毒扁豆堿。
有時會使用硫酸阿托品滴眼液擴大瞳孔。