衣原體是最常見的性傳播感染之一，有幾種抗生素可用于治療。最流行的兩種衣原體藥物是強力霉素和阿奇霉素，被認為是最有效的抗生素。氧氟沙星和左氧氟沙星通常也能成功地消除感染，但它們往往比前兩種藥物貴。孕婦在使用衣原體藥物時通常不得不使用其他選擇，因為最流行的治療方法之一，強力霉素在懷孕期間并不安全，因此，孕婦更有可能服用紅霉素或阿莫西林。
某些衣原體藥物對孕婦不安全。
強力霉素長期以來都是衣原體的首選藥物，因為研究表明，它在根除該病方面是最成功的。它通常是最便宜的衣原體藥物，但它的缺點之一是需要每天服用兩次，持續7天。孕婦或哺乳期的患者不能服用，因為它對未出生的嬰兒和嬰兒來說是不安全的，相反，這類患者可以服用阿奇霉素，這是治療衣原體的第二大熱門藥物，它的主要好處是患者只需服用一劑就可以消除感染，但缺點是服用這種藥物后，她們必須等待一周才能進行性交。
阿莫西林是另一種藥物一種衣原體藥物，雖然它被認為和強力霉素和阿奇霉素一樣有效，但通常更昂貴這是醫生不常給藥的主要原因。與強力霉素一樣，氧氟沙星需要每天服用兩次，持續一周，孕婦和哺乳期婦女不能服用。左氧氟沙星是一種類似的藥物，有時會被其他衣原體藥物替代，但它通常和氧氟沙星一樣貴。
通常，治療孕婦衣原體的藥物在治療感染方面不如其他抗生素有效。
阿奇霉素只是被認為在懷孕期間安全使用的衣原體藥物之一，但也有更便宜的選擇。醫生也可能會開一些便宜的阿莫西林，盡管這類青霉素很少用于未懷孕的患者，因為它不如其他衣原體藥物有效。另一種廉價且對孕婦有效的選擇是紅霉素。紅霉素被認為是最不受歡迎的衣原體藥物之一，因為它需要一年服用四次多西環素是用來治療衣原體的抗生素之一。