微波輻射的危險性取決于暴露的時間長短、與輻射源的距離以及發射裝置的功率水平。計算微波輻射的危險性很大程度上取決于它在輻射頻譜中的位置，例如位于該列表頂部的伽馬射線等高頻波，微波頻率比無線電波稍強一些，而電視和電腦屏幕的輻射直接低于無線電波，屬于極低頻輻射。電離輻射也比非電離輻射危險得多，因為它有可能損害人體細胞中的DNA。高能伽馬射線，x射線，一些紫外線是電離的，但不是微波。
電離輻射有可能導致未出生嬰兒出生缺陷。
比普通可見光更有能量。這并不是說微波輻射根本不構成任何風險，因為暴露在微波爐中是很常見的。不僅微波爐會發出微波輻射，但手機也是如此。
微波爐的主要危險是距離太近。這是一個標準微波爐能發出600-700瓦的能量來烹調食物。根據美國聯邦的指導方針，使用中的微波爐允許的最大輻射泄漏量為5毫瓦，即每平方厘米0.005瓦（5兆瓦/平方厘米）這種輻射泄漏也會以距離輻射源1平方英寸的距離下降10倍。如果有人在微波爐工作時距離微波爐1英寸（2.5厘米）的距離接收到5毫瓦的輻射，后退10英寸（25.4厘米）的距離將使輻射量減少100倍，或者0.00005瓦特。
相比之下，手機的微波輻射水平大約是每平方厘米1毫瓦（1兆瓦/平方厘米）電話信號通常在300瓦的范圍內。在靠近手機發射塔的房屋中，典型的微波功率水平比國際輻射防護協會（IRPA）規定的限值低100萬倍。
微波爐輻射的能量低于普通可見光。
將手機及其接收天線稍微遠離頭部，將其裝入便攜袋中，或者使用耳麥，這樣裝置就可以在一定程度上減少暴露在微波輻射下的程度。然而，關于手機潛在危險的研究仍在繼續，特別是在成長中的兒童使用手機的地方。警察在巡邏車中使用的雷達探測器也會產生微波，目前正在對這些單位進行研究，以確定是否存在長期暴露風險，但迄今為止，證據尚未顯示出任何不良影響盡管有這一消息，俄羅斯的研究表明，長期暴露在極低水平的微波輻射下會造成健康風險，這導致俄羅斯和歐盟的安全限值為1 mW/cm2，而美國的安全限值為5 mW/cm2。
手機的微波輻射水平約為每平方厘米1毫瓦（1毫瓦/平方厘米）。
從2011年起，微波輻射的最大危險可能是它在烹調時對某些食物分子造成的潛在風險，以及礦物質分解成更小的分子，這些小分子幾乎沒有營養價值。烹飪過程也會產生放射性化合物，這些化學物質被輻射作用分解，可能會對健康造成危害，例如致癌、降低免疫功能或損害記憶。由于這些未知因素，在醫院里，嬰兒配方奶粉和輸血用的血液從來不會被微波輻射加熱。眾所周知，某些軟塑料食品包裝如果被用作容器或微波爐的覆蓋物，就有可能將塑料化合物滲入食品中，因此，我們建議食物只能在明確指定為微波安全的玻璃或塑料中進行微波爐加熱。
來自蜂窩塔的微波傳輸通常為300瓦。