二者都屬于選擇性血清素和氟西汀類藥物，它們是如何影響體內的血清素類藥物的，但也可用于治療不同的情況。制造商提供不同形式的氟西汀和舍曲林，每種藥物都有不同的給藥說明。每一種藥物都有一些相同但也有許多不同的可能副作用。
舍曲林是以片劑形式提供的。
醫生開這兩種藥物來治療與強迫癥和經前期精神障礙。然而，這兩種藥物都是治療其他幾種疾病的理想藥物。氟西汀通常用于治療暴食癥、抵抗性抑郁癥以及與雙相情感障礙相關的抑郁癥。
氟西汀的平均劑量治療兒童抑郁癥的劑量在10到20毫克之間。
制造商生產10毫克、20毫克和40毫克氟西汀膠囊以及90毫克延遲釋放膠囊。醫生也可以開10毫克、15毫克或20毫克氟西汀片。舍曲林有25毫克、50毫克或100毫克的片劑在大多數情況下，液體形式的氟西汀和舍曲林可以代替片劑。液體形式的氟西汀每5毫升溶液提供20毫克氟西汀，而液體舍曲林每毫升溶液提供20毫克舍曲林
突然停用舍曲林可能會導致腹部痙攣。
成人每天服用20至80毫克氟西汀治療抑郁癥，兒童的平均劑量在10到20毫克之間。氟西汀治療強迫癥的平均日劑量成人和兒童為20至60毫克。治療經前精神障礙的推薦劑量為婦女月經周期內每天服用20毫克氟西汀。
抑郁和焦慮癥在女性中是男性的兩倍。
舍曲林方案與氟西汀方案稍有不同。舍曲林治療抑郁癥和強迫癥需要每天服用25至50毫克的藥物。醫生推薦的治療經前煩躁癥的平均每日劑量為50至150毫克在月經周期中的一天。
雖然通常處方用于治療抑郁癥，但服用舍曲林的一些副作用對治療早泄是有益的。
氟西汀和舍曲林會引起一些相同的副作用，包括惡心、食欲不振、皮疹，氟西汀的其他副作用包括癲癇發作、血壓升高和血管炎癥。服用舍曲林時可能出現體重減輕、口干和心跳不規則等癥狀
氟西汀和舍曲林都屬于選擇性5-羥色胺再攝取抑制（SSRI）抗抑郁藥家族。
長期服用這兩種藥物中的任何一種都可能導致患者對藥物的依賴性。在服用后可能會出現惡心和其他戒斷癥狀突然停止使用氟西汀。突然停止使用舍曲林可能導致出現流感樣癥狀、腹部絞痛，以及記憶障礙。隨著時間的推移，逐漸減少這些藥物的劑量有助于降低患者出現戒斷癥狀的可能性。
氟西汀和舍曲林通常都是用來治療經前煩躁癥的。
氟西汀通常用于治療貪食癥。
舍曲林和氟西汀的副作用可能包括失眠。