腎上腺素和阿托品這兩種藥物都會影響神經系統中調節心率、呼吸和消化等自動行為的部分，也就是所謂的自主神經系統。這些藥物的一些作用甚至重疊，比如在給藥后增加心率。但是它們有很多重要的區別，這可以決定它們在醫療環境中的正確使用。
阿托品滴眼液可用于某些眼科手術的瞳孔擴張。
自主神經系統，但它們是通過這個系統的不同亞群來實現的。在一個稱為交感神經系統的亞群中，腎上腺素激活了系統內被稱為神經元的細胞，幫助觸發所謂的"戰斗或逃跑"反應。副交感神經系統的作用是相反的，比如降低血壓和心率。阿托品可以阻斷副交感神經分支神經元的正常活動，這意味著它也可以提高心率，盡管其途徑與腎上腺素不同。
腎上腺素從腎上腺釋放，刺激交感神經系統。
腎上腺素和阿托品對人體的不同作用導致了獨特的臨床用途。注射腎上腺素可逆轉導致呼吸困難和其他主要問題的過敏反應。這種藥物也可用于逆轉心臟驟停。阿托品不能重新啟動心臟，但它被用來逆轉低心率，即心動過緩某些涉及眼睛的程序也會使用阿托品滴眼液，因為這會導致瞳孔擴張。
阿托品可用于逆轉低心率或心動過緩，所有藥物都有可能引起一些副作用，這些副作用是腎上腺素和阿托品的另一個區別。腎上腺素的許多可能的副作用都與過度刺激有關，如緊張、失眠、心動過速，或者心率升高和震顫。這些影響與阿托品引起的相似，但阿托品有更大的幾率增加出汗、皮膚潮紅和精神副作用。這些精神副作用可能包括困惑、幻覺，甚至妄想，個體會對不真實的刺激做出反應在那里，忘記了它是由藥物引起的。
阿托品的副作用可能包括出汗。
藥物相互作用是腎上腺素和阿托品本質不同的另一種方式心臟藥物和影響血壓的藥物，如β受體阻滯劑，與腎上腺素一起服用可能致命。使用阿托品，可能導致死亡的副作用較少，但許多化合物，包括苯海拉明之類的抗組胺藥、呼吸道藥物和利尿劑，會導致排尿，會使阿托品的副作用更為嚴重。
腎上腺素和阿托品與其他藥物的相互作用差異很大
注射腎上腺素可用于逆轉導致呼吸困難的過敏反應。
阿托品不能重新啟動心臟。
有效降低血壓和心率。
腎上腺素的副作用可能包括失眠。
心動過緩的患者心率可能低于每分鐘50次。