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    生物學家和物理學家怎么做朋友?

            與物理學家合作,讓我學會更好地進行學術溝通,同時也幫忙我弄清晰了自身的常識空白,Ken Kosik如是說。

    神經科學家Kenneth S. Kosik。來歷:Sonia Fernandez

    作為一名大夫兼科學家,當我將嘗試室從布萊根配偶女病院的波士頓長木醫學區,搬到加州大學圣塔巴巴拉分校(UCSB)時,很多同事都感應很是驚奇,究竟結果那邊既沒有醫學院,也沒有大學從屬病院。

    我收到不止一封郵件——有迷惑、有不測、也有理解,但他們無一破例都用了感慨號。

    十年前的那次搬家,源于我想和物理科學研究人員成立更慎密的合作關系,發現生物學框架內普遍合用的道理,層層揭開幾乎每一個生物學問題背后都埋沒著的復雜謎團。

    波士頓并不缺物理學家。事實上,他們堪稱宿世界一流。但那時我的嘗試室位于查爾斯河的“醫學”一岸,可以說與對岸哈佛大學的物理科學嘗試室相去甚遠。是以,和物理學家、化學家、計較機科學家或工程師交流,很是具有挑戰性,出格是對于一名只接管過度子和細胞生物學練習的醫學博士來說。

    我的方針不是當作為一名物理學家,而是和物理學家們進行對話,并在可能的環境下睜開合作。之所以選擇UCSB,是因為它作為學術機構,規模相對較小,但在物理學和工程學范疇擁有浩繁精采的人才。恰是因為我的冒險行為,在接下來的十年中,我和計較機科學、工程、物理和化學系的同事配合培育了很多研究生和博士后。這些合作極大地拓展了我的論文內容的廣度。

    我擬定了一些簡單的法則,幫忙我跨過生物學和物理學之間那道線。在進修若何與物理學家打交道的過程中,我發現我的溝通能力獲得了晉升,并且我還弄清晰了在生物學,也就是我本身的范疇中,哪些是我大白和不大白的。

    01 理解物理學家口中的“我不睬解”

    若是物理學家說他們不克不及理解您所說的生物學內容,那意味著您對這個本家兒題可能也只是一知半解。

    “理解”在分歧學科中有分歧的寄義,當物理學家想要“理解”某項內容時,他們但愿把握的內容可能和生物學家紛歧樣。

    舉個例子,生物學家理解基因轉錄,意味著領會特定的轉錄因子及它們的連系位點,知曉RNA聚合酶的感化以及被激活的基因。

    但在物理學家看來,基因的名字和連系位點——轉錄的主要內容——都是可有可無的細節。他們但愿知道的是轉錄復合體連系到具體位點的概率分布,以及此中涉及的感化力的量化。

    顯然,若是生物學家拋開固定的認知框架,這些問題就變得很是有意義。

    02 尋找配合話題

    當物理學家說他們不領會生物學范疇的某個方面時,他們需要的并不是“生物學十萬個為什么”那樣的詮釋。以我的經驗,當物理學家扣問生物學問題時,他們是想將物理學的思惟應用于生物學;具體來說,他們試圖找到通用的數學詮釋。

    物理學家對既定的事實不感樂趣。但生物學里有的是懸而未決。與其滾滾不停地講述已知的生物學常識,不如講講您想解決的問題。

    生物學范疇良多有待解決的問題都是定量的細節,例如單個細胞中介導某種功能的卵白質或RNA的絕對拷貝數,以及細胞若何確保那么多條調節通路正常運作。細胞是否會按期進行自我維護,改換故障零件,就像人們檢修飛機那樣?仍是只有發生毀傷才會觸發“改換零件”?毀傷有時候紀律可循嗎?解答生物學中的這類未知問題,遠比復述教科書上的內容更具開導性。

    03 看清謙善背后的驕傲

    我發現,常常涉及生物學問題,物理學家們老是表示得很謙善。他們老是說生物學比物理學難多了,因為有良多工具需要記憶。他們可能會說:您知道大量細節,而我只知道幾個等式。

    04 數學是生物學的短板

    對于大大都生物學現象,我們并沒有切確的方程式——這一點與物理學分歧。這不是說生物學全然不涉及數學,只是需要更詳盡的量化。缺乏量化數據是生物學的致命弱點,甚至影響到我們的日常生物學概念。

    很少有生物學家可以或許詮釋RNA測序中利用的負二項分布;可以或許在評估本家兒動轉運和擴散時,將細胞器的外形和距離標準參數化;或可以或許解讀生物分子縮合物相對應的相圖——盡管越來越多生物學家對這部門內容感樂趣。

    扎實的計較機常識對生物學家來說,是一筆龐大的財富,可是很多人沒有機遇考驗,甚至沒有機遇接觸這些技術。從我的經驗來看,與物理科學家進行交流并開展學生結合培育,是填補常識空白的第一步。

    05 別被物理學家的數學唬到

    物理學家做研究闡發的最終方針是獲得一個公式。寫下方程后,他們會像賞識 Mark Rothko(馬克·羅斯科)的畫作一樣,凝望它們,然后可能提出一種詮釋。即便您沒有良多物理學根本,不知道哈密頓量或無法對伊辛相變進行建模,您仍能和物理學家進行卓有當作效的溝通。請記住,對于數學,物理學家比數學家更敏感,數學家不受實際束厄局促并將四周宿世界視為一個約束。

    愛因斯坦說過:“數學定律離實際越近,就越不確定;數學定律越確定,離實際就越遠。”生物學家必需充實接管不確定性。與物理學理論杰出的展望性比擬,生物學范疇的展望(例如進化)更像股市周期——只有在回首時,才能真正看清。

    06 起首確定巨細標準

    從這個角度考慮一下:大部門環境下,物理學家所做的研究與生物學家所做的研究比擬,標準系統分歧,情況溫度也分歧。

    生物學家應該知道大分子的巨細——包羅細胞器和與之相關的細胞,并起首考慮它們對應的物理學系統標準是什么。

    07 物理學家對切確度要求更高

    物理學家對結論的精確性要求更高。當您獲得P值小于0.05的成果時,他們并不會出格興奮。對他們而言,P值等于0.05,就仿佛用棒球擊中谷倉門:您不會掉手的。

    08 避免太多專業術語

    讓物理學家頭大的最快方式是什么?背誦生物學術語,例如基因表和通路。細心想想,這會讓任何人頭昏腦脹。

    09 不必事無大小

    物理學家不必知道所有被節制的前提。他們需要的只是概念,他們會假定您已經恰當節制了變量并選擇了準確的嘗試方式。若是要為物理學家做“粉筆演講”(繪圖講解),請務必強調概念設法,而不是具體的數據和手藝。物理學家進行判定的根本是清楚、有力、令人信服的設法。

    10 理性對待預期

    物理學家會等候您建造本身的設備。若是一個理論家提出了這個定見,不要放在心上。但若是是嘗試人員提出的,那或許您就不得不認可為買現當作的設備,您可能多花了良多錢。

    11 理解“最優”和“差不多”

    生物學過程自帶進化潛能,是以一時獲得的解決方案未必是最佳的。好比,若是您想設計一個可以或許行走的機械,以人作為模子可能不是最好的,因為人類步行未必是達到目標地最有用的方式。物理學宿世界沒有進化,是以經常被假定是按照最優參數運行的。比擬之下,生物學則在所謂的“沃丁頓地帶”(Waddington terrain)中運行:即使不是最高效的,只要差不多,生物學過程也可以或許正常闡揚感化。

    12 物理學家眼中的還原論

    利用還原論方式處置復雜生物系統,并紛歧定意味著將這些系統拆減為多個小單位。利用涉及多個變量的系統方式解決生物學問題,自己就很輕易吸引物理學家,因為它們在概念上與統計力學問題近似——將微不雅和宏不雅特征與很大的自由度聯系在一路,且無法提出切確的謎底。若是生物學家可以利用這些術語,對研究問題進行描述,也許就能吸引到物理學家。

    13 共同物理學家的詼諧

    物理學家的笑點很奇異,幾乎所有出乎料想的工作都可以帶來歡喜。物理學家的笑話一般都很有內在,并非剎時就能找到笑點。但笑一笑無妨——即便您并不感覺好笑,歸正他們也看不出來。

    選擇適合本身的路

    最后,我想說,我走的道路并非適合每一小我。起首得知道本身想要什么。若是您不肯與非同業的專家接觸,或者不想鉆研可能與自身范疇沒有明白聯系的本家兒題,那么我所選擇的路可能并不適合您。但若是您不僅可以或許順應這種跨學科合作的方式,并且火急但愿從外界獲得靈感,那么就斗膽地邁出第一步吧,沒什么比未知宿世界更值得等候的了。

    本文經授權轉載自微信公家號“Nature天然科研”。原文以Thirteen tips for engaging with physicists, as told by a biologist為題目頒發在2020年 1月6日的職業專欄上。

    撰文 | Ken Kosik

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    • 發表于 2020-02-12 02:00
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