酶在消化過程中起著關鍵作用。雖然淀粉酶的結構和類型因生物體而異,但所有淀粉酶分子都有一些共同的特征。α和β淀粉酶都含有一種稱為桶狀區的結構,這一結構有助于大部分酶的整體形狀。這些酶也都有一個重要的區域,叫做活性中心。這是酶結合一個復雜的糖或淀粉以分解它的部分。在活性中心分解碳水化合物的過程涉及多個原子和離子之間的相互作用,淀粉酶是一種分解淀粉的酶,在唾液中分泌,無論是在唾液中還是在胰腺中,淀粉酶的結構都是相似的。人類淀粉酶的兩種變體都是由一條稱為氨基酸的單鏈組成的小分子,氨基酸鏈形成三個不同的區域,稱為結構域,每一個結構域都有一個特定的生物功能來輔助碳水化合物崩潰其中兩個結構域緊密結合在一起,而第三個結構域在淀粉酶之間有很大的差異,盡管它們相似,但唾液淀粉酶和胰腺淀粉酶是不可互換的;胰淀粉酶通常完成唾液淀粉酶開始的工作。雖然淀粉酶的結構通常很簡單,有一些變體比大多數的要復雜得多。大多數α-淀粉酶的長度非常相似,但有些可以折疊成三個以上的共同結構域。有些β-淀粉酶與α-淀粉酶相比是巨大的,它包含四個獨立的氨基酸鏈,而不是一個。在這種情況下,淀粉酶的結構比其他大多數作物大四倍。許多常見的糧食作物都含有這種類型的淀粉酶,包括大麥、大豆和甘薯,但淀粉酶分子的大小對提高或降低植物的營養特性沒有任何作用。
胰腺含有α-淀粉酶。
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