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    如何高效地使用藥物靶點預測系統

    藥物靶點展望系統普遍地應用于展望化合物靶點、老藥新用研究、分子機制研究及中藥當作分收集藥理學研究等,可是仍有不少伴侶在扣問若何利用,為什么沒有獲得展望成果。不妨,下面供給一下傻瓜式操作及注重事項。

    東西/原料

    • 基于谷歌內核開辟的瀏覽器如谷歌、搜狗、360等等
    • 藥物靶點展望系統的賬號暗碼

    方式/步調

    1. 1

      賬號登錄

      先輸入網址,然后輸入賬號、組織號及暗碼即可。

    2. 2

      建立使命

      進入系統后,點擊建立,彈出使命建立框。有圖可見,使命建立包羅繪制/導入布局、選擇展望方式、相似值及活性分子庫等參數。

    3. 3

      選擇參數-繪制/導入布局

      起首,在右邊窗口繪制或者導入當地布局,既可以點擊“添加”,經由過程內嵌于系統的布局編纂器ipmDraw繪制布局;也可以點擊“導入”,添加當地布局文件(mol/sdf格局)。

    4. 4

      選擇參數——選擇展望方式及相似值

      添加布局后,可以按照本身的需求合理地選擇展望方式及相似值。系統供給二維/三維相似度算法,建議選擇二維相似度時,相似值設置為70%較為合適;選擇三維相似度時,相似值設置為60%較為合適。

    5. 5

      選擇參數——選擇活性分子庫

      接著,按照本身的需求選擇活性分子庫。系統供給兩類,一種是藥物庫,已上市的藥物集,約2600多個,數據量較少;兩外一種是配體庫,公開辟布的活性小分子集(包羅文獻、專利等),約七十萬多個。若想獲得更多的展望成果,活性分子庫建議選擇配體庫

    注重事項

    • 選擇配體庫后,我們會發現呈現“閾值”參數,該參數是活性小分子的活性閾值,默認全數。
    • 發表于 2018-12-20 00:00
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