穿透海洋表面的光量決定了生活在給定深度的動植物的類型。海底有底棲或底棲生境。它們是珊瑚礁分為較淺的沿海底棲和大陸架以外的深海底棲生境。珊瑚礁是一種生活在淺海、溫暖水域的底棲棲息地,在那里有大量的光線穿透。珊瑚礁以其巨大的生物多樣性而聞名,它依賴于造礁的珊瑚群。在珊瑚礁內,微環境在礁石的前部,波浪作用最大的地方和暗礁后面較平靜的地區,它們支持著不同的群落。在深海海底的深海平原上發現了一種截然不同的海底棲息地。這里,沒有光穿透,沒有發現植物。生活在這個海洋棲息地的生物主要是以碎屑為食的生物,依靠漂浮在海底的有機物為生。由于所涉及的困難,研究很少,這片深海被認為是豐富的生物多樣性。化學合成是在冷泉和熱液噴口附近發現的獨特環境中生命的基礎。海帶森林和錨定的海帶床存在于足夠的沿海地帶光透過水來維持植物的生命。這些棲息地主要分布在極地和溫帶地區豐富的棲息地支持著海洋生物的多樣性,海帶森林提供了一個垂直的水下環境。從表面的樹冠到海帶林底部的底棲環境,每一個區域都有一個獨特的生物群落。這種海洋棲息地已經被廣泛研究,在經濟上也很重要。
由于海浪的影響,靠近海岸的水下生命可能會很艱苦。
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