一些處理系統依賴于能吞噬石油污染的微生物。植物修復的概念其實相當古老,盡管人們直到20世紀末才意識到這一潛在的影響,但幾個世紀以來,農民們一直以植物修復的形式輪作農作物,防止潛在有害物質在土壤中的積聚,并用豆類等植物豐富土壤,它將氮固定在土壤中,使其他植物可以利用。這些做法產生了一種更廣泛的植物修復實踐,即利用植物積極地將污染物從地下和水中排出。植物修復有多種形式。許多植物能夠吸收并儲存污染物,也就是說,人們可以種植樹木或植物,把污染物從土壤中抽出來后再移走。植物也可以用來控制污染的擴散。有些植物會積極代謝污染物,分解成無害的物質,另一些則刺激微生物的生長,使其能夠代謝污染物。順便說一句,微生物也被用于環境修復有幾家公司實際上已經通過基因工程改造了食用石油和核廢料等物質的微生物,而且新的極端微生物不斷地在各種環境中被發現。這表明細菌在某個時候可能能夠完成大部分的環境清理工作,植物修復當然也有一些缺點,它比一些環境修復技術需要更長的時間,需要耐心,在某些情況下,還需要為后代安裝警告標志。植物修復還存在將危險物質引入食物供應的風險,由于所使用的植物可以食用,或者如果污染點得不到嚴格控制,它們可以作為食用動物的食物來源。有些植物在吸收污染物時也會產生污染,表現出各種可以被水或風攜帶的物質。
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