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    新冠疫情下美國的病毒檢測是怎樣的?

    疫情暴發后,想要節制疾病傳布,最主要的莫過于將病毒檢測的假陰性率降至最低。在今天登載的幾篇日志中,史雋教員記實闡發了關于病毒檢測的諸多信息。

    撰文 | 史雋

    原題目:《117疫情不雅察 | 史雋·波士頓篇·Ⅱ》

    3月25日 周三

    MA累計確診 1838例

    昨晚睡覺前聽到哥倫比亞大學聞名風行病學家W. Ian Lipkin傳染了新冠病毒的動靜,很是震動。

    來歷:NBC news

    Lipkin傳授被稱為宿世界領先的“病毒獵人 (virus hunter)”。他仍是史蒂文·索德伯格(Steven Soderbergh)2011年的片子《流行癥》(Contagion)的首席科學參謀。

    在2003年非典期間,他受中國科學家和當局官員的邀請來到中國,幫忙擬定了節制病毒傳布和削減傳染的策略。2003年4月,他直接從患者的肺組織中測序出一段SARS冠狀病毒 (SARS-CoV-1) 的序列而且研發出了首個針對SARS冠狀病毒的敏感診斷測試。鐘南山院士就是在他的建議下,把非典界說為病毒傳染,改變了國內按細菌來治療的政策。

    非典事后,他與中國的科學家和當局官員合作無懈,幫忙中國增強公共衛生系統。他幫忙成立了上海的巴斯德研究所、海說神聊京的新國度疾病節制中間和廣州市生物醫學與健康研究所。

    此次1月底2月初,他也去了中國。固然不克不及去武漢,仍是在廣州和海說神聊京呆了一段時候。

    鐘南山院士和Lipkin傳授在廣州機場 (來歷:哥倫比亞大學官網)

    來歷:China Daily

    我記得很清晰,2月17日下班開車回家,聽到了美國電臺NPR對他的采訪。那是他回到紐約,在家隔離的最后一天。采訪里他說:新冠病毒和SARS病毒一樣,發源于野活潑物;測序成果表白它可能來自蝙蝠,經由過程某種中心宿本家兒,可能是小型哺乳動物,傳染到人。他還強調了,今朝沒有證據證實這種病毒可能發源于生物嘗試室或者是某種生物兵器。

    他認為當前最主要的工作是研發一個活絡的檢測方式,可以找出無癥狀傳染者,而不是用輻射很大的CT來檢測病人。這樣才能有用的節制擴散。

    此刻的大大都測試只能用于已經生病并呈現癥狀的患者,只有這類患者才能測得精確成果。

    就在3月19日,Lipkin傳授的團隊頒布發表研發出了一個敏感的測試方式,可以檢測到無癥狀或者輕癥狀COVID-19患者體內的少量病毒。主要的是,這種被稱為C3 (CII COVID-19Coronavirus Assay) 的新測試可以削減假陰性和假陽性率,不僅削減了不知不覺傳布病毒的人的數目 (假陰性),并且削減了不需要的醫療資本華侈 (假陽性,即隔離或治療因其他原因生病的人)。可惜該測試固然活絡,但今朝僅限于研究利用,還沒有大規模用于排查。

    最小化假陰性率對于節制疾病傳布至關主要。這個新檢測法對新冠病毒的特異性很高,不會與其他病毒發生交叉反映,從而導致假陽性,導致不需要地隔離患者。

    他認為今朝節制疫情最好的東西是隔離 (isolation) 和限制 (confinement)。

    Lipkin傳授在接管采訪的時辰說:“若是我會傳染新冠病毒,那么誰都有可能會傳染。”

    If it can hit me, it can hit anybody. That’s the message I want to convey.

    1952年出生的Lipkin傳授已經68歲,但愿他能早日康復。

    馬薩諸塞州簡直診人數俄然增添了良多,似乎已經進入指數增加期。州長頒布發表黌舍將一向封閉到5月4日。

    FDA又告急核準利用了兩個COVID-19診斷測試:

    1) 由Mesa Biotech公司開辟的手持式儀器 (見下圖)

    2) 由BioMérieux的子公司BioFire與美國國防部合作開辟的全主動檢測法,可以在約一個小時內供給成果。

    來歷:FierceBiotech

    https://www.fiercebiotech.com/medtech/fda-authorizes-hand-held-covid-19-diagnostic-test

    同時,FDA也發警告提醒大師:

    消費者應謹嚴采辦或利用賣方聲稱有助于診斷、治療、治愈或預防COVID-19的產物。

    今朝尚無FDA核準的預防或治療COVID-19的疫苗和藥物。

    利用欺詐性的產物可能會導致人們延遲或遏制恰當的治療,并可能危及生命。

    來歷:CNBC

    https://www.cnbc.com/2020/03/25/fda-warns-consumers-against-fraudulent-coronavirus-tests-vaccines-and-treatments.html

    3月26日 周四

    MA累計確診 2417例

    Trump昨天發了一條twitter,說:“到今朝為止,美國做的‘新冠病毒測試’已經遠遠跨越任何其他國度!現實上,在曩昔八天的時候里,美國進行的測試要比韓國(曩昔被認為長短常當作功的測試的國度)在八周的時候內做的測試更多。“

    在之后的新聞發布會上,他又把這點說了好幾遍。

    然而,總統做的比力并不科學。風行病學家做比力凡是利用的是人均檢測率,測試的絕對數目不是很有意義。

    盡管美國在冠狀病毒檢測的總數上跨越了韓國,但鑒于美國生齒是韓國的六倍多,是以美國的人均檢測量卻少得多。

    截至昨天 (3月25日),按照韓國CDC的陳述, 5100萬生齒的韓國進行了357,896項新冠病毒測試。(數據來歷:https://www.cdc.go.kr/board/board.es?mid=a20501000000&bid=0015)

    比擬之下,美國根基屬于各州自治,每個州零丁統計報告請示本身的測試數據,有幾個州不陳述陰性成果數目或成果待定的測試數目,所以很難精確地統計美國到底有幾多人接管了新冠病毒測試。

    《大西洋》(The Atlantic)雜志的撰稿人Alexis Madrigal帶領了一個有100多名當作員的義工小組,匯總了各州當局網站和當局官員供給的數據,報告請示在Covid Tracking Project上。按照他們的統計,截至昨天 (3月25日), 3.29億生齒的美國進行了至少418,810項新冠病毒測試。(數據來歷:https://covidtracking.com/data/)

    按照這些數據,韓國的人均檢測率是1/142,而美國只有1/786。

    要達到韓國測試的籠蓋面,美國還要測良多才夠。

    師兄發來他在超市買工具的照片,列隊結賬每人世隔至少2米,落實了媒體天天絮聒的“social distancing”。

    攝影 | 安德魯魚

    3月27日 周五

    MA累計確診 3240例

    FDA又告急核準利用了一個新的檢測方式:由雅培 (Abbott) 公司開辟的、今朝最快的新冠病毒測試 (Abbott ID NOWCOVID-19 test),陽性成果5分鐘可以讀出,陰性成果13分鐘可以讀出,并且體積小巧便攜,幾乎可以在任何醫療情況中利用。

    該手藝基于雅培的ID Now平臺。這個平臺是美國今朝最常用的即時查驗儀器,全美大約有18,000多個這樣的重量不到7磅的小機子,普遍用于檢測流感、鏈球菌性喉炎 (strep throat) 和呼吸道合胞病毒 (respiratory syncytial virus,一種引起傷風癥狀的常見病毒)。

    上周,雅培公司的m2000 RealTime系統也獲得了美國FDA的告急核準利用, 用于病院和分子嘗試室診斷傳染。這個系統每周最多可以進行100萬次測試,可是需要的時候更長。

    雅培公司打算從4月1日起頭天天供給50,000個ID Now測試,兩個系統加起來,每月至少供給500萬次測試。

    ID Now系統是雅培公司2016年2月份收購的Alere公司開辟的。其檢測道理是:將病人的鼻或咽拭子樣本與化學溶液夾雜,病毒分裂從而釋放RNA;將這個夾雜物插入ID Now系統中,經由過程等溫核酸擴增手藝連系轉錄介導,可以定性測微量的RNA,擴增大約150堿基的小段,這一小段是新冠病毒的特異序列,分歧于其他病毒。若是樣本里面有新冠病毒,擴增5分鐘今后就能發生足夠的旌旗燈號,可以判定為陽性。而若是擴增13分鐘今后仍然沒有旌旗燈號可以判定為陰性。

    和師兄們研究了一晚上這背后的黑科技,最后仍是有些細節不甚大白。感受固然速度快,但不如傳統的RT-PCR方式嚴謹,沒有一個很好的control來確保取樣過程可能會有的問題,假陰性率也會高一些。

    但不成否定,即時臨檢 (Point-of-care testing) 在疫情大面積暴發的時辰仍是有很大的優勢的。

    雅培病毒檢測機 (來歷:Abbott Laboratories雅培嘗試室)

    -未完待續-

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    • 發表于 2020-04-06 02:00
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