地衣和真菌通常被用作指示物種。指示物種的存在通常定義了一個特定的生態區域。例如,某種類型的樹木可能只生長在非常特定的區域,或者特定的哺乳動物只能在特定的區域漫游區域。如果物種開始消失,生態區域可以說是在縮小,這可能會引起對該地區環境健康狀況的擔憂。許多組織都在追蹤指示物種的存在,特別是在脆弱地區,觀察棲息地是否正在縮小或被破壞。
指示物種是一種特定的植物,它可以告訴研究人員它的環境。這些物種也可以更廣泛地用于收集有關環境健康的信息。一些指示物種之所以被特別選擇是因為它們對污染或人類干擾極為敏感,因此追蹤這些物種的研究人員可以及早發現問題。其他物種可能會生病,這表明存在需要解決的疾病,或者它們可能遷移或發展壓力行為以應對氣候變化。所有這些自然秩序的變化都可以被觀察和跟蹤,以保持對環境的關注。指示物種在歷史上被用來收集許多地區的地質組成的信息例如,某些植物在特定礦物質的存在下會大量生長,因此這些植物的存在可能是這些礦物質可能豐富的跡象,表明水源豐富時存在水源。已知一些植物也會因特定礦物和化學物質的存在而變色。研究人員根據實地調查、歷史記錄和,當一個政府機構使用這類系統時,它通常會仔細地記錄確定的過程,以防其他機構或公民對基于指標物種作出的決定提出質疑。
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