從事微生物診斷學工作通常需要廣泛的培訓細菌、原生動物和真菌等微生物在許多疾病過程中起著作用。當病人出現由感染引起的疾病時,醫生通常想確定是哪種微生物造成的,以便選擇最佳的治療方法。診斷微生物學家從病人身上采集樣本,培養樣本,觀察生長情況,并將結果返回給醫生
微生物學家可以使用培養皿來研究細菌。除了參與致病微生物的鑒定外,診斷微生物學也可以成為制定治療計劃的一部分例如,許多微生物對藥物產生了耐藥性,因此可能會要求微生物學家用培養的生物體對各種藥物進行測試,以找到最有效的治療方法。臨床微生物學家也可以被要求尋找多種感染性有機體的跡象,或提供對感染病理學的深入了解。
微生物學有時被用于醫學診斷診斷微生物學也可以應用于流行病學。臨床微生物學家通常參與流行病的早期跟蹤和研究,以確定所涉及的生物體,找出它們之間的聯系,并幫助制定一種方法來阻止這一流行病,治療已感染的人。他們的技能也將用于確定誰屬于該流行病,誰不屬于該流行病,利用他們的診斷技能追蹤傳染病的傳播,并區分普通感染者和感染者流行病。在診斷微生物學領域工作的人通常接受過廣泛的培訓。培訓的性質可能會有所不同,這取決于科學家的工作地點。培養和鑒定常規標本的實驗室技術人員,例如,在面對公共衛生威脅時,從事新的和未知生物的流行病學家的培訓往往較少,對診斷微生物學領域的職業感興趣的人應該計劃參加大量的科學和數學課程
微生物學家可能會收集水樣以檢測有害微生物。
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