什么是亞硫酸氫鹽測序(Bisulfite Sequencing)？
亞硫酸氫鹽測序是一種利用甲基化分析DNA不同區域的方法。甲基化是在核苷酸中加入一種稱為甲基基團的特定分子的過程，在這種情況下通常是一個胞嘧啶。不活躍的核苷酸通常被甲基化，因此這種方法可以用于各種目的，在亞硫酸...
亞硫酸氫鹽測序是一種利用甲基化分析DNA不同區域的方法。甲基化是在核苷酸中加入一種稱為甲基基團的特定分子的過程，在這種情況下通常是一個胞嘧啶。不活躍的核苷酸通常被甲基化，因此這種方法可以用于各種目的，在亞硫酸氫鹽測序中，甲基化胞嘧啶不受測序過程的影響，而非甲基化胞嘧啶則轉化為尿嘧啶，而尿嘧啶是一種在遺傳物質脫氧核糖核酸（DNA）中不常見的核苷酸
DNA是一種天然的雙螺旋結構的化學鏈，這種方法對甲基化的變化非常敏感，因此，結合的微小變化可以給研究人員提供有關特定核苷酸的特定信息。亞硫酸氫鈉將胞嘧啶轉化為尿嘧啶，但這種轉化發生在甲基化胞嘧啶不會發生這種變化的環境中。當亞硫酸氫鈉測序完成后，原始的DNA已經被轉換成一個顯著不同的分子。胞嘧啶將被大大耗盡或可能消失。如果在這個轉換的分子中仍然發現一個胞嘧啶，它代表了正在考慮的基因組中的一個自然甲基化的胞嘧啶
在亞硫酸氫鹽測序中，科學家使用甲基化來分析DNA的不同區域像所有的實驗方案一樣，亞硫酸氫鹽測序也有缺點。它最大的缺點是它需要很高的鹽濃度才能正常工作。鹽會促使單鏈DNA退火成更自然的雙螺旋，而亞硫酸氫鈉作為雙鏈DNA的一部分時，并不總是能到達細胞分裂素，如果鹽濃度過高，許多細胞質可能無法轉化為尿嘧啶，導致對基因組中甲基化胞嘧啶的錯誤鑒定。變性劑可能是減少假陽性鑒定的必要手段。大量的基因組數據對亞硫酸氫鹽測序是不必要的，因此，該方法在臨床標本分析中有很好的應用價值，其來源不重要，但必須是DNA，理論上可以用這種方法對核糖核酸（RNA）進行測序，由于大多數RNA都是單鏈的，由于核苷酸被阻斷，因此不易出現假陽性。然而，在實際應用中，亞硫酸氫鹽測序對RNA是沒有用的，因為RNA中自然含有尿嘧啶。如果沒有某種外部標記或附加到協議中，轉換的胞嘧啶與天然尿嘧啶是無法區分的。當進行任何類型的測序方法時，精確性和精確性是至關重要的，像亞硫酸氫鹽測序這樣敏感的方法提供了一種可靠的序列分析方法，這反過來又允許基因分析和識別藥物和治療的靶點雖然這種方法不能用在活人身上，但它仍能對只有最小的組織樣本起到很大的幫助。
DNA是一種天然的雙螺旋結構的化學鏈，這種方法對甲基化的變化非常敏感，因此，結合的微小變化可以給研究人員提供有關特定核苷酸的特定信息。亞硫酸氫鈉將胞嘧啶轉化為尿嘧啶，但這種轉化發生在甲基化胞嘧啶不會發生這種變化的環境中。當亞硫酸氫鈉測序完成后，原始的DNA已經被轉換成一個顯著不同的分子。胞嘧啶將被大大耗盡或可能消失。如果在這個轉換的分子中仍然發現一個胞嘧啶，它代表了正在考慮的基因組中的一個自然甲基化的胞嘧啶在亞硫酸氫鹽測序中，科學家使用甲基化來分析DNA的不同區域像所有的實驗方案一樣，亞硫酸氫鹽測序也有缺點。它最大的缺點是它需要很高的鹽濃度才能正常工作。鹽會促使單鏈DNA退火成更自然的雙螺旋，而亞硫酸氫鈉作為雙鏈DNA的一部分時，并不總是能到達細胞分裂素，如果鹽濃度過高，許多細胞質可能無法轉化為尿嘧啶，導致對基因組中甲基化胞嘧啶的錯誤鑒定。變性劑可能是減少假陽性鑒定的必要手段。大量的基因組數據對亞硫酸氫鹽測序是不必要的，因此，該方法在臨床標本分析中有很好的應用價值，其來源不重要，但必須是DNA，理論上可以用這種方法對核糖核酸（RNA）進行測序，由于大多數RNA都是單鏈的，由于核苷酸被阻斷，因此不易出現假陽性。然而，在實際應用中，亞硫酸氫鹽測序對RNA是沒有用的，因為RNA中自然含有尿嘧啶。如果沒有某種外部標記或附加到協議中，轉換的胞嘧啶與天然尿嘧啶是無法區分的。當進行任何類型的測序方法時，精確性和精確性是至關重要的，像亞硫酸氫鹽測序這樣敏感的方法提供了一種可靠的序列分析方法，這反過來又允許基因分析和識別藥物和治療的靶點雖然這種方法不能用在活人身上，但它仍能對只有最小的組織樣本起到很大的幫助。
- 發表于 2020-08-05 17:48
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- 分類：醫療衛生
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