避孕套不一定能預防生殖器皰疹。目前正在研究的皰疹病毒主要有兩種類型:單純皰疹病毒I型(HSV-I)是一種皰疹病毒這會引起口腔潰瘍,而單純皰疹病毒II型(HSV-II)是一種會引起生殖器潰瘍和損傷的皰疹病毒。僅在美國,就有20%的人口感染了一種或兩種皰疹病毒。盡管有不少研究人員試圖找到疫苗或治療方法,由于美國國立衛生研究所(NIH)只為其收到的申請提供8%的資金,研究人員主要依賴私人資金
傳統疫苗對持久性病毒(如皰疹)通常不起作用。一種類型的皰疹研究集中在防止病毒感染個體和控制皰疹病毒的傳播。傳統的疫苗是由刺激人類免疫反應的弱病毒或死病毒制成的。這類疫苗對皰疹等持久性病毒無效。研究人員正在開發亞單位疫苗,亞單位疫苗比傳統疫苗更安全,因為它們不能繁殖并導致疾病的發生。其他疫苗可能會中斷病毒的DNA指令,產生一種削弱宿主細胞防御能力的物質單純皰疹病毒I型是一種引起口腔潰瘍的皰疹病毒,另一種類型的皰疹病毒正試圖控制病毒的傳播通過陰道栓劑的開發而產生的病毒。這些外用殺菌劑含有能殺死病毒和防止感染的物質,在與被感染者性交之前使用。目前控制皰疹傳播的唯一方法是通過抑制性藥物如阿昔洛韋、泛昔洛韋和瓦拉昔洛韋
生殖器皰疹患者只要感覺良好就可以獻血。研究人員認為,殺死已經感染的人的皰疹病毒的唯一方法是激活它,等到它從隱藏在背神經節神經細胞里出來,然后殺死它。一些皰疹研究正在研究哪些基因負責病毒的活動。理論認為一旦病毒被激活,可以用阿昔洛韋這樣的藥物治療,問題在于如何同時激活所有休眠的病毒,當皰疹病毒在體內休眠時,它的某些部分會在不同的時間激活,因此不可能同時治療整個病毒1型皰疹引起的水皰。
陰道栓劑可用于控制皰疹的傳播。
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