氮循環,包括構成硝化作用的步驟,是發生在土壤中的一個關鍵過程氮以氮的形式占地球大氣的80%。這種氮不能被依賴它們的植物或動物利用。細菌需要把氮轉化為氨(NH3)和銨離子(NH4+)。在一個叫做硝化作用的過程中,土壤細菌轉化氨進入硝酸鹽離子(NH3)中。氮循環的這一部分被稱為固氮,使植物產生所有動物生命所依賴的氨基酸和其他含氮化合物。每年雷擊和一些非生物化學過程會產生極少量的固定氮為了完成氮循環,死的動植物的有機物被另一類細菌分解,這個過程釋放出固定的氮,稱為反硝化作用,氮以最初的N2形式或氨的形式重新進入大氣由于一項重要的科學發現,人類不再需要依賴細菌產生的可用氮,這就產生了合成氮基肥料,農業上大量依賴這些肥料來養活世界上相當多的人。這樣,人類已經成為氮循環的重要組成部分,據估計,環境中有多達50%的固定氮是由于人類活動而存在的固氮細菌。一些植物的根,特別是豆類植物,在根上有根瘤,細菌在那里產生氮,可以直接被植物利用。反過來,細菌從植物中獲取有機物質,一些動物如牛和水牛的消化道中也有固氮細菌,這些細菌能產生大量動物所需的含氮化合物。
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