什么是基因組瀏覽器(Genome Browser)？

基因組瀏覽器是一個網絡界面，用來查看染色體的物理圖。這張圖顯示了兩個基因之間的DNA分離程度，以堿基對來衡量，人類染色體的大小從5000萬到超過2.5億個堿基對不等。基因組瀏覽器可以顯示整個染色體的示意圖，也可以"放大"...

基因組瀏覽器是一個網絡界面，用來查看染色體的物理圖。這張圖顯示了兩個基因之間的DNA分離程度，以堿基對來衡量，人類染色體的大小從5000萬到超過2.5億個堿基對不等。基因組瀏覽器可以顯示整個染色體的示意圖，也可以"放大"單個基因的示意圖，甚至是實際的堿基對序列

基因組瀏覽器是用于查看染色體物理圖的web界面。基因組瀏覽器允許用戶在染色體上滾動并放大某些特定的染色體位置。許多基因組瀏覽器允許用戶在查看實際DNA序列的水平上進行放大，盡管瀏覽器的真正用途在于能夠在更大范圍內查看基因，而不是在核苷酸水平上查看DNA序列。一個基因的平均大小為3000個堿基對，因此，當放大到堿基對水平時，用戶看到的不到一個完整的基因。人類最大的基因dystrophin有240萬個堿基對用戶可以在染色體上滾動并放大某些位置。除了查看基因的示意圖外，基因組瀏覽器還可以顯示其他有用的信息這可以包括被翻譯成蛋白質的基因部分，稱為mRNA，以及除了編碼蛋白質以外還有其他功能的DNA序列。基因組瀏覽器還可以顯示在基因組測序過程中使用了哪些DNA片段大量的有機體已經對基因組進行了測序。基因組學領域沒有一個標準的瀏覽器，因此基因組瀏覽器可能在測序的基因組之間有所不同。基因組瀏覽器具有搜索感興趣的基因或序列的功能，允許用戶從一個基因組位置跳轉另一方面，由于大多數染色體的體積非常大，在染色體上滾動以找到感興趣的位置是沒有效率的。一些基因組瀏覽器有一個叫做基因分類的工具。這個工具顯示一個基因表這種關系可以是幾種類型中的一種：序列同源性、相似的表達譜或基因組相似性。用戶使用一個詞或短語搜索一個基因，選擇他或她想要的關系類型，然后基因分類器顯示搜索結果。

發表于 2020-08-24 16:00
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分類：醫療衛生

什么是基因組瀏覽器(Genome Browser)？

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