許多穴居動物已經存在,包括許多哺乳動物、昆蟲、兩棲動物、爬行動物(包括小恐龍)、甲殼類動物、蠕蟲,甚至還有一些魚類和鳥類,是由5.42億年前化石記錄中出現的復雜洞穴來定義的。這些穴居動物打破了以前擁擠缺氧的海底,允許...
許多穴居動物已經存在,包括許多哺乳動物、昆蟲、兩棲動物、爬行動物(包括小恐龍)、甲殼類動物、蠕蟲,甚至還有一些魚類和鳥類,是由5.42億年前化石記錄中出現的復雜洞穴來定義的。這些穴居動物打破了以前擁擠缺氧的海底,允許更大的生物多樣性和物種間的競爭。穴居被認為是一種抵御捕食的進化。許多生態捕食者和獵物之間的軍備競賽可以描述為穴居動物與試圖將動物從洞穴中弄出來的捕食者最著名的穴居動物是哺乳動物,包括兔子、花栗鼠、鼴鼠、地鼠和土撥鼠。一只土撥鼠的洞穴占1立方米,而復雜的兔子窩可能占據數百立方米的空間。有些動物,如有袋鼴鼠,已經適應了如此廣泛的洞穴,以至于它們失去了眼睛,只能用嗅覺和觸覺來捕食獵物。在澳大利亞,穴居兔在18世紀末被引進,此后繁殖失控,破壞了大片的灌木叢,導致許多其他物種滅絕。

兔子生活在洞穴里雖然我們對哺乳動物穴居動物最為熟悉,但非哺乳動物穴居動物也很常見,尤其是在海洋中。整個動物門,如佛龍和泥龍,都生活在自己建造的洞穴里,完全依靠伸入水中的微小纖毛生活。一些海洋動物可以分泌特殊的化學物質,這些化學物質可以在海洋中生存允許它們直接在堅硬的巖石中挖洞,盡管速度很慢。海洋中最多產的穴居動物是多毛類蠕蟲,一種水棲環節動物,是專門的海底清道夫。這些洞穴幫助它們逃離海底食肉魚類的下顎一些從地表動物進化而來的穴居動物對黑暗的地下生活有著非同尋常的適應能力。星鼻鼴鼠有一個由極其敏感的鼻觸角組成的感覺器官,叫做艾默氏器官。鼴鼠用這些器官來探測非常小的獵物動物星鼻鼴鼠也被稱為自然界中吃東西最快的動物,它只需120毫秒(比人眼所能跟蹤的還要快)來識別和吃掉獵物。

蚯蚓是一種穴居動物。