一些系統理論家研究蜂巢中的生物系統是如何工作的。系統理論是生物學研究的必然產物。在分析了自然界中的生態系統之后,系統理論家將系統的基本邏輯應用于非生態現象,匈牙利科學家貝拉·H·班納希(Bela H.Banathy)等該領域的先驅者認為,明確界定系統概念是建立任何科學基礎的必要條件,許多系統理論家試圖發展一種通用理論來解釋任何可想象的系統的功能。這種方法將根據相同的一般原則和法律解釋蜂巢或政府等不同的系統。這樣的假設推斷所有系統都有一個基本的邏輯整體。根據學術文獻中關于系統究竟是什么構成的爭論,人們提出了許多不同的系統理論方法,一個系統的關鍵特征被確定為感知的各個部分之間的關系,從而形成一個整體實體。這種方法根據統一的關系集和行為模式來定義系統的一致性,也稱為封閉系統。例如,蟻群系統是由作為其成員的特定螞蟻的各種行為模式構成的這些不同的行為又會相互關聯,產生一個系統的整體同質性的概念,根據其一致的功能定義。一些學者反對用開放系統的概念來定義封閉系統的概念。他們認為,任何封閉系統的定義都包含簡化系統本質的簡化謬論。相反,開放系統理論家強調,很多時候,系統可以定義為它們排除的東西,而不是它們所包含的東西,或者那些不被視為系統一部分的部分,涌現是系統理論的一個重要組成部分,它描述了一個簡單的部分之間的關系如何創造出完全不同于這些部分的東西的現象。涌現的常見例子包括互聯網和股票市場。
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