線粒體是真核生物的一個決定性的細胞器。此外,真核生物細胞可能有一系列用于運動或保護的表面特征,這在原核生物中是沒有的,例如鞭毛,例如在人類精子中發現的鞭毛,以及在植物中發現的細胞壁真菌細胞有一個幾丁質細胞壁,這是昆蟲用來做外骨骼的材料。像蘑菇這樣的真菌接觸起來不會感覺很硬,因為它們的甲殼素壁的厚度遠小于昆蟲和其他獸腳類動物的甲殼素外骨骼
紅藻被認為是最早的真核生物之一,可追溯到12億年前。真核生物比原核細胞具有更大的復雜性和多樣性。真核細胞中的一些細胞器實際上是原核生物的祖先,它們曾經與真核生物有共生關系,但后來被真核生物吸收了。例如線粒體和葉綠體。線粒體甚至有自己的DNA,隨著進化時間的推移,這些DNA已經慢慢轉移到保護較好的細胞核中真核生物在地球上的生命中比原核生物更近。原核生物在34-27億年前進化,真核生物在21-16億年前進化,盡管一些證據表明可能起源于27億年前。最早的真核生物化石可以追溯到12億年前,以紅藻的形式存在,海藻的一種。
細胞器區分真核生物和原核生物。
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