抗原可以引起免疫反應,迫使抗體產生對抗該抗原的抗體。IHC抗體用于不同的實驗技術。石蠟或塑料包埋的薄組織切片中的抗體染色通常用于原位找到抗原。IHC抗體也可用于實驗沉淀技術,如共免疫沉淀分析,重點是將抗原從溶液中取出,以量化大面積組織中存在的抗原量當上清液暴露于預先包被的IHC抗體的底部后,測量能夠通過組織培養板的光照量的方法也經常被用來量化均質組織樣本中抗原的數量用于抗原檢測的單一抗體。這些方案通常用于植入非反應性基質中并安裝在玻璃載玻片上的組織樣本。這些單抗體染色程序在用熒光團等檢測分子標記自身抗體的實驗室中也很流行。然而,更常見的是,抗體染色法要求使用一級和二級抗體。一級IHC抗體針對一種特殊的抗原,這可能是不常見的研究。二級IHC抗體將針對主要的IHC抗體而產生。然而,次要抗體將被標記到一個識別分子上,如生物素或一種熒光團。這種雙抗體技術很常見,因為公司可以節省資金,將熒光團或昂貴的標記試劑添加到針對某一物種的免疫標記物的大量抗體中,而不是將昂貴的試劑標記到針對某一抗原的抗體上,而這種抗體可能很少有人研究科學家。。
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