原核細胞比真核細胞更原始。原核細胞和真核細胞最顯著的區別是后者形成復雜生物體的能力。原核生物都是單細胞生物而真核生物包括植物、真菌和動物。結合和合作的能力使真核生物的發展遠遠超出了原核生物。
植物細胞具有稱為質體的細胞器。兩種細胞類型都含有相似的元素。這兩種類型都是以脫氧核糖核酸(DNA)為基礎的生物,含有一種細胞膜、鞭毛、細胞質和核糖體。它們具有相同的DNA和相同的遺傳密碼。一個區別是原核生物的DNA是圓形的,而真核生物的DNA是線性的。真核生物的DNA與組蛋白結合形成染色體,而原核生物的DNA則不細胞,細胞核包含并處理細胞的大部分DNA。原核細胞和真核細胞之間最顯著的生理差異是前者缺少真核。細胞核包含并處理真核細胞的大部分DNA,它的功能是控制細胞的活動,細胞核被包含在一個膜內,使它與細胞的其他部分分開。原核生物有一個類核仁的中心,DNA在那里聚集,但沒有分離膜內膜是兩種細胞類型之間反復出現的差異。真核細胞充滿了被稱為細胞器的不同的微型器官。這些膜結合的元素在細胞內執行特定的功能,與細胞的細胞質不同。原核生物往往沒有與細胞質分離的細胞器細胞質是一種包含在細胞內的粘性液體,而原核細胞和真核細胞都有核糖體,真核細胞中的核糖體更大更發達,核糖體利用氨基酸和核糖核酸(RNA)在細胞內產生蛋白質。原核核糖體由三種核糖體RNA(rRNA)和大約50種蛋白質組成。然而,真核生物核糖體由五種類型的核糖體和大約80種類型的核糖體組成真核細胞含有一種獨特的細胞器叫做線粒體,植物細胞也有被稱為質體的細胞器。原核生物細胞兩者都沒有。線粒體和質體似乎有一個共同的起源。兩者似乎都是不同的原核生物,在真核生物中以永久的共生關系被吸收。一些普遍的差異因排除而變得復雜。一般來說,這些細胞壁上的細胞不同。雖然所有的原核生物都有,而大多數真核生物沒有,但也有例外。一些原核生物已經發育出原始的細胞器,但通常是沒有的。
單細胞古生菌是原核生物。
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