細菌性軟腐病和真菌會損害鳶尾花。在種植鳶尾鱗莖時,最好避免在過去幾年中出現這些花的斑點,除非目的是擴大現有的、健康的花壇,否則許多虹膜疾病會在土壤中存活數年,而新的植物如果接觸到它們,很容易受到感染。如果選錯了地方,很可能會導致植物在發芽后不久枯萎死亡,盡管有些植物可能活得足夠長,在它們死亡之前就開花了鳶尾屬植物易受多種類型的感染。鐮刀菌枯萎病是一種真菌感染的例子,一旦它進入土壤,它會困擾花很多年。這個問題通常首先感染植物的根部,引起枯死的褐色斑點,看起來凹陷,摸起來很軟。第一個明顯的癥狀可能是葉子又短又黃,在把這些葉子拔出來后不久植物就會死亡。另一種由真菌引起的虹膜疾病是芥子真菌,也被稱為冠腐病和南方枯萎病。植物生長出一種褐色的粘液,覆蓋在花和葉的底部,并可能沿著植物蔓延,殺死植物健康和不健康的部分這經常攻擊太平洋沿岸的鳶尾花和五顏六色的有胡須的鳶尾花,但是如果它一旦建立起來,植物和土壤都必須從該地區移開,以防止進一步傳播。某些類型的虹膜疾病是由昆蟲活動引起的。細菌軟腐病就是這樣一個問題,當細菌進入由虹膜蛀蟲的活動引起的植物傷口時,就會發生細菌性軟腐病隨著葉子感染,植物會散發出惡臭,通常沒有任何明顯的原因,仔細觀察通常會發現虹膜蟲留下的小孔,唯一的解決辦法可能是把整個植物挖出來丟棄,尤其是根莖。細菌性葉斑病是虹膜的一種病害,對植物來說并不一定致命,但它仍然會造成嚴重的損害。葉子上會出現大的濕斑,首先出現在邊緣,然后向中心擴散并變成褐色,隨著葉子的死亡,最終會變成白色。嚴格的衛生條件有助于控制這種感染的傳播,清除任何受感染的葉子也是如此。葉子必須從該區域完全清除,并且永遠不要落在堆肥堆上或花園邊緣附近。
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