什么是Contig(Contig)？
contig是contig的縮寫，是指脫氧核糖核酸（DNA）片段或重疊片段的產物，這些片段形成一個連續、廣泛、不間斷的DNA序列。通過研究這些片段的圖譜，可以發現包含各種序列的片段的順序，并且可以添加、刪除contigs，或者重新排列以形...
contig是contig的縮寫，是指脫氧核糖核酸（DNA）片段或重疊片段的產物，這些片段形成一個連續、廣泛、不間斷的DNA序列。通過研究這些片段的圖譜，可以發現包含各種序列的片段的順序，并且可以添加、刪除contigs，或者重新排列以形成新的序列。DNA連接性圖譜和文庫使研究人員能夠識別可能導致疾病的排列，更好地了解細胞在特定條件下的反應，使研究人員能夠識別可能導致疾病的排列。基因組連接通過重疊匹配的序列標記集或匹配表達的序列標簽相互連接構建塊法：由DNA片段的堿基組成的程序，contigs可以復制或克隆成需要的序列，增加或消除不太有利的片段。研究人員將這些序列視為高度詳細的計算機化DNA程序上的地圖。該程序提供了用于構建片段的堿基的可視分解，以及用于構建特定序列的片段。使用不同的顏色方案，不同的contig程序將這些信息顯示為低、中、高質量的序列。contig映射經常揭示遺傳疾病的原因。例如，威廉姆斯綜合征在兒童中會產生多系統癥狀，包括心血管問題，血鈣水平升高，以及發育不良。研究人員發現了影響某些基因的條帶缺失，這可能是由不適當的重疊引起的另一種兒童遺傳性疾病，cri-du-chat綜合征，也會產生多種癥狀，科學家認為每一種癥狀都與缺失和異常定位有關。研究人員還分析了植物物種中的contig序列。每種植物都含有該植物特有的序列，并通過獲得各個植物物種的圖譜，科學家們發現了可能導致某一特定植物類型的健康或退化的相似和不同的特征，醫生可以確定可用于治療發展的性狀。繪圖通過序列刪除或克隆提供了對可能的基因操縱的直觀見解。科學家可以在細菌人工染色體、酵母人工染色體中培育克隆的DNA樣本，或在P1或噬菌體人工染色體培養基中。這些染色體含有50到數十萬個堿基，這些堿基組成連續的片段。在定殖一段時間后，用注射器提取樣本并放入DNA測序凝膠中，經過電泳和干燥后，放射自顯影儀讀取樣本并在序列上留下指紋。研究人員隨后將指紋掃描到圖像文件中，然后將其加載到contig程序中
- 發表于 2020-09-07 11:18
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- 分類：科學教育
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