細胞因子風暴可能是高傳染性病毒(如流感)最嚴重癥狀的原因。這些蛋白質在免疫反應中的作用是復雜的。單個細胞因子可以影響幾種不同類型的細胞,并且可以發揮一種功能,而幾種不同的細胞因子可以發揮相同的功能,不同類型的細胞對同一種細胞因子的反應是不同的,細胞因子可以以不同的方式相互作用,例如,一種可能抑制另一種細胞因子的作用;兩種細胞因子共同作用可能產生協同效應;一種細胞因子可以刺激其他細胞的產生。細胞因子可以影響產生它們的細胞——這些細胞被稱為自分泌——或者它們可以影響附近的細胞——這些被稱為旁分泌。不太常見,它們可能通過血流影響遠處的細胞,這些細胞被稱為內分泌。
內源性熱原通過影響下丘腦的溫度控制而引起發熱和炎癥反應。許多不同的細胞因子與先天免疫系統有關趨化因子通過趨化作用影響免疫細胞的運動,并能將這些細胞吸引到損傷或感染的部位,通過影響下丘腦的溫度控制和促進脂肪和蛋白質分解產生熱量,引起發熱和炎癥反應;它們還刺激趨化因子的產生。干擾素有多種功能,與此相反,白細胞介素10(IL-10)對免疫反應有本質上的抑制作用。其他類型的細胞因子在適應性免疫系統中起作用。白細胞介素2,4和5(IL-2,IL-4和IL-5)刺激多種免疫細胞的生長發育,轉化生長因子β(TGF-β)主要是功能上的抑制,影響各種免疫細胞的增殖,并通過阻斷內源性熱原的作用來降低發熱,干擾素γ(IFN-γ)在先天性和適應性中都有活性免疫反應。在骨髓中,另一組細胞因子起著重要作用。這一組細胞因子刺激血液循環,即骨髓白細胞的生長和成熟成不同類型。例如白細胞介素3和7(IL-3和IL-7),盡管這些蛋白質在協調免疫反應以消除威脅方面起著至關重要的作用,但它們有時會加重由病原體引起的疾病或導致疾病本身。細胞因子的過度產生,也許是對一種新的和不熟悉的病原體的反應,會導致細胞因子風暴,導致嚴重的危及生命的組織炎癥有人認為1918年流感大流行期間的高死亡率是由于這種影響,而不是病毒本身的直接影響,過敏癥和自身免疫性疾病。一些癌細胞會產生有助于刺激其生長的細胞因子。
細胞因子風暴是人體對感染的過度反應。
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