氫鍵可以出現在DNA和其他有機分子中氫鍵最普遍和最簡單的例子是在水中,每個水分子通過氫鍵與四個相鄰的水分子結合。每個水分子中的氧原子有兩個單獨的電子可以提供,與其他水分子中的氫原子迅速結合。此外,每個氧原子與相鄰水分子中的氧分子相連的兩個氫原子。這種分子間的鍵合是水相對較高沸點的原因。相對于由相似大小的分子組成的材料,水具有極高的沸點。如果這些鍵不存在,水在與二氧化碳相似的溫度下沸騰(二氧化碳的沸點為-78°C或-108.4°F),我們知道生命是不可能的
水分子是氫鍵最簡單的例子。氫鍵由氫鍵受體、目標原子和氫鍵施主氫原子組成。有時,在氯仿(CHCl3)這樣的分子中,碳可以參與氫鍵,特別是當被氯等負性原子包圍時。氫鍵是不尋常的,通常稱為靜電偶極-偶極相互作用(弱分子間相互作用),把它和電荷瞬時量子漲落引起的更多瞬變鍵結合在一起,但它也有許多更強大的共價鍵的特性,在共價鍵中電子云實際上是直接重疊的。這些特性包括方向性、強度、比典型的原子間距離短的產生瞬時范德華相互作用,以及有限數量的相互作用伙伴,這是對更強鍵的診斷。氫鍵的長度取決于鍵的強度,溫度,粘結強度還取決于許多因素,包括溫度、粘結角、壓力和環境。在水中,氫鍵的典型長度為1.97?(197pm)。
氫原子與電負原子形成相對較弱的鍵。
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