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    什么是基因組數據庫(Genome Database)?

    基因組是一個有機體中所有遺傳物質的集合。由于這些遺傳物質的序列和結構決定了整個生物生命的發展,科學家們對找出它們的作用非常感興趣。基因組數據庫是一個或多個有機體的交叉引用信息集合,因此,一個科學家可以查看所...
    基因組是一個有機體中所有遺傳物質的集合。由于這些遺傳物質的序列和結構決定了整個生物生命的發展,科學家們對找出它們的作用非常感興趣。基因組數據庫是一個或多個有機體的交叉引用信息集合,因此,一個科學家可以查看所有可用的遺傳信息來幫助他或她進行研究。遺傳學家可以使用基因組數據庫來識別他們正在研究的基因,或者找出該基因的作用基因組是高度復雜的,在信息序列中包含數十億個堿基。因此,計算機化數據庫是在一個地方組織細節的唯一可行方法。一般來說,這些都可以作為科學研究的在線數據庫,一個相對較新的科學領域,叫做生物信息學,已經出現了,它完善了通過計算機系統解釋生物數據的方式基因組數據庫包含一個有機體的基因序列,如果整個序列是已知的。否則,它可能包含部分序列。例如,人類、小鼠和果蠅基因組已經測序。當基因組序列已知時,遺傳學家可以識別基因組中的特定基因。每個基因都是一種特定細胞產品的說明書如果一個基因發生突變,它與正常的功能基因有不同的序列。突變可能是有益的,并在突變的有機體中產生一個有用的特性。它們也可能對產品沒有影響,也可能對生物體的正常工作有害。例如,許多醫療條件,突變也可以用來計算一個特定物種和另一個物種之間的密切關系,因為隨著時間的推移,越來越多的突變累積在一起。個體的基因組序列也會發生變化,特別是大的基因組的一部分不是基因,也不編碼任何必需的細胞產物。基因組數據庫保存著一個有機體的序列,這個序列被指定為一個標準,但是任意選擇的標準和一個物種中的其他個體之間會有許多微小的差別盡管存在許多差異,基因還是可以通過序列識別出來的。如果遺傳學家知道某個特定基因在一個有機體中的作用,那么在另一個動物中具有相似序列的基因很可能具有相同的功能。遺傳學家可以使用基因組數據庫來識別他們正在研究的基因或是找出基因的作用。每個基因組數據庫都是可搜索的。通常,科學家可以用幾種不同的方法搜索數據庫。通常,他或她可以輸入他或她已經測序的基因序列,然后,數據庫會找到一個或多個相似的序列進行比較搜索數據庫的一種更簡單的方法是查找基因關鍵字,例如基因的名稱。美國國家生物技術信息管理局(NCBI)等權威機構可以給出序列不同的參考號,遺傳學家也可以使用這些標識符中的一個來搜索基因組數據庫。他或她也可以使用更多的搜索參數來縮小搜索范圍。交叉引用信息是大多數基因組數據庫的一個特點,一個單一的序列結果也將為數據庫用戶提供有用的鏈接,以獲取更多的遺傳信息。除了關于特定序列的信息外,許多數據庫還提供了該序列和該區域顯著特征的可視化表示一些不同的物種數據庫可以包含不同的物種數據庫,但是這些數據庫可以包含更多的物種控制數據庫,歐洲生物信息學研究所,甚至個別大學。
    • 發表于 2020-08-25 03:50
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    • 分類:科學教育

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