凋亡是程序性細胞死亡的另一個名稱過程相當復雜,但基本上,一個細胞從細胞內或細胞外得到信號開始分解,這些碎片隨后被標記為被生物體內的吞噬細胞"吃掉",這就防止了細胞內任何有害物質或編碼對機體其他細胞的影響程序性細胞死亡被認為是動物早期和胚胎期生長發育的一個特別重要的組成部分,例如,有證據表明,人類胎兒單個手指和腳趾的早期發育是由于存在于手指之間的細胞死亡,剩下的細胞形成單個的手指。同樣,蝌蚪的尾巴在變成青蛙時重新融入身體是由于細胞死亡,而不是這些尾細胞的持續分裂和生長不幸的是,某些病毒和其他不利的生理條件會阻礙細胞程序性死亡。癌癥在動物體內的擴散通常是由于細胞凋亡在機體內的不恰當發生。在理想情況下,癌細胞應該被體內的蛋白質命令死亡,阻止癌細胞分裂和擴散。但是,在許多癌癥病例中,程序性細胞死亡并不正確,導致潛在的致命細胞擴散到全身人類免疫缺陷病毒(HIV)同樣以一種消極的方式利用程序性細胞死亡,使通常抵抗病毒和其他感染的T輔助細胞開始自我毀滅。這種情況被稱為獲得性免疫缺陷綜合癥(AIDS),有效地破壞了人體的免疫系統經常導致并發癥或死于其他疾病。
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