熒光素衍生物可在實驗室環境中用于識別流體樣品中的化合物在實驗室科學中,熒光素可用于蛋白質標記,以及其他一些任務。在實驗室之外,這種染料歷史上曾被用于追蹤河流流量和污染物流量,盡管由于擔心這些做法對環境的影響,在一些地區已經被取代了這種化合物,但這種化合物也被用于染料激光器和其他一些需要能夠發出熒光的科學儀器中歷史上,水文學家一直使用熒光素來追蹤水流通過感興趣水體的流動。在這種情況下,一種被稱為"點源"的負荷會在一個設定的位置釋放出來,并隨著它在水中的移動而變化。除了提供有關水流的數據外,熒光素的運動也可以用來追蹤污染物,用這種化合物標記污染物并觀察其去向。這些信息可用于環境凈化工作。幾家化工公司生產熒光素及其衍生物,例如異硫氰酸熒光素。這些公司可以銷售包裝成粉末或溶液的產品,各種尺寸以滿足用戶的需求。這種化合物是使用最廣泛的熒光分子之一,在科學網站上可以找到大量關于這種化合物作用的照片
眼科醫生可在眼科檢查期間使用熒光素。
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