頭發,骨骼和牙齒是線粒體DNA分析的理想選擇。細胞核DNA只存在于細胞核中,父親和母親各一份。線粒體在細胞內產生能量并大量存在。在核DNA降解或缺失的樣本中,線粒體DNA(mtDNA)的數量較大意味著仍可以進行檢測。頭發、骨骼和牙齒是線粒體DNA分析的良好候選對象人體的大部分已經腐爛或者被燒毀,骨頭和牙齒通常只剩下骨頭和牙齒。
當細胞受損時,線粒體DNA不太可能被破壞限制性片段長度多態性(RFLP)和短串聯重復序列(STR)分析是最常用的,只測試核DNA。MtDNA不僅更豐富,而且在細胞內攜帶的更深,所以不太可能當電池損壞時被破壞。即使樣品是舊的,它也不會降解這使得線粒體DNA分析成為解決感冒病例的一個非常有價值的工具。測試從收集和記錄樣本開始。拍照是因為這個過程會破壞材料。一旦目視檢查完成后,仔細清洗樣本,去除可能影響結果的任何污染物。然后,樣本將被處理成多個DNA副本,可進行分析并與對照品進行比較。所有這些都與母體有關,比如有同一個母親的兄弟姐妹會有完全相同的線粒體DNA,雖然這種分析方法無法區分個體,但它通常用于失蹤人口或發現不明遺骸,因為幸存的母系親屬可以提供一個比較樣本。線粒體DNA分析也可以用動物DNA進行,幫助科學家追蹤物種的世代線粒體DNA分析已經被用來鑒定美國逃犯杰西·詹姆斯以及查麗娜·亞歷山德拉·費奧多羅夫娜·羅曼諾娃及其子女的遺骸,一名婦女聲稱她是皇后的女兒阿納斯塔西婭,在家族被處決后幸存下來,但在mtDNA顯示她是一個名叫弗朗齊斯卡·肖茨科夫斯卡的波蘭人之后,她就失去了信譽。對一個據稱是瑪麗·安托瓦內特的兒子路易·查爾斯(在法國大革命期間死于獄中)的孩子心臟組織進行分析,女王頭發上的線粒體DNA顯示這個孩子很可能是個不幸的王子
線粒體DNA分析有助于識別人。
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